Движение статолитов.

Раз уж мы занялись движением, то движение наше не остановить: свет, камера, мотор! Не будем ограничиваться одними растениями, перейдём к несколько более подвижным формам жизни. Возьмём наземную улитку, скорость движений которой воспел ещё Кобаяси Исса. В своём движении вверх по склону улитка ориентируется на специальные вестибулярные органы чувств — статоцисты. Устроены они просто: внутри шара из чувствительных клеток лежит инерциальная масса из кристаллов арагонита (статолиты), куда масса навалится, оттуда, значит, и вектор ускорения. Чтобы повысить скорость работы статоциста, чувствительные клетки биением своих ресничек эту инерциальную массу всё время держат в контакте, и даже крутят отдельные кристаллы, если сил хватит. Особенно хорошо это видно у молодых улиточек, которые ещё не отрастили крупных кристаллов в инерциальной массе:

Обычно биение ресничек чувствительных клеток никак не упорядоченно, и отдельные кристаллы беспорядочно двигаются в броуновском стиле, насколько позволяют соседние кристаллы и стенки статоциста. Однако, иногда на статоцист приходит определённое влияние со стороны, и тогда все реснички начинают синхронно крутить инерциальную массу в одну сторону, как это видно на микроскопической анимации выше. Оставим пока за рамками рассказа, что это за влияние, и попробуем как-то оцифровать наблюдаемое движение для дальнейшего его научного изучения.

Для этого возьмём научно-ориентированную программу анализа растровой графики Fiji и изучим имеющиеся в ней плагины для трекинга. Так как нас интересует одновременный трекинг многих статолитов, то часть плагинов сразу пролетает мимо. Ещё два (MTrack2 и MultiTracker) не удалось запустить (ява, на которой написаны ImageJ и Fiji — это не просто ужас, это ужас-ужас). Из двух оставшихся, TrackMate и Mosaic ParticleTracker, второй выдал более адекватные траектории по имеющимся данным, с ним и будем работать. Пока вот такой сайнс-арт нарисовался: